Calcaterra è stato operato al cervello ma le sue condizioni di salute continuano a preoccupare. Il controllo della Duomo rimane a Tempofosco, impegnato a cercare di placare la guerra di mafia che impazza tra le famiglie Maglio e Corvo. Intanto la Pm Ferretti è stata portata in una località protetta dopo un altro tentativo dei Maglio di arrivare alla chiave dell'archivio di Crisalide che lei nasconde. Tempofosco ha capito che la donna ha un segreto e cerca di ottenere la sua fiducia, con metodi che però fanno insospettire Lara Colombo, il vice questore che mal si rassegna alla perdita del comando.
